MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR06

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013749	GCCG	2	8	7	14	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013749	CG	3	6	364	369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013749	GCC	2	6	372	377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013749	TAG	4	12	433	444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013749	G	6	6	1180	1185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013749	AC	3	6	1230	1235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013749	GTGAG	2	10	1249	1258	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013749	ACC	2	6	5063	5068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013749	ACT	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013749	CAG	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013749	CTTAC	2	10	6895	6904	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013749	TGAC	2	8	6939	6946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013749	GAG	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013749	GGC	2	6	6977	6982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013749	ATT	2	6	12365	12370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013749	TC	3	6	12416	12421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013749	GT	3	6	12437	12442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013749	AAG	2	6	12485	12490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013749	T	6	6	12545	12550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013749	AC	3	6	12634	12639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013749	AGC	2	6	12729	12734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013749	GTCG	2	8	12768	12775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013749	GCCG	2	8	12779	12786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013749	GGA	2	6	12832	12837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013749	ACA	2	6	12922	12927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013749	AG	4	8	13848	13855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013749	TAGT	2	8	13863	13870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013749	TCC	2	6	13916	13921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013749	CA	3	6	13926	13931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013749	GAGG	2	8	13934	13941	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013749	CG	3	6	13974	13979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013749	AAAAGA	2	12	13992	14003	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013749	CG	3	6	14038	14043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013749	GGTGTA	2	12	14094	14105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013749	ATAC	2	8	14111	14118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013749	TCA	2	6	14135	14140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013749	AGG	2	6	14177	14182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013749	GCA	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013749	ACC	2	6	15088	15093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013749	AACG	2	8	15121	15128	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013749	TA	3	6	15181	15186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.